Il existe de nombreuses couleurs de Yoshi. Le premier Yoshi rencontré par Mario est vert. Ce Yoshi n'apparaît pas dans Super Mario Sunshine donc prend la couleur orange, rose ou violet selon le fruit qu'il mange.

Ces couleurs servent à distinguer les espèces (Dans Super Mario world)

La couleur Verte : une espèce commune qui peut avoir une des trois compacités ,créer des mini séismes ( en mangeant un Koopa jaune ) ,il peut voler provisoirement (en mangeant un Koopa bleu), il peut cracher trois boules de feu (en mangeant un Koopa rouge), par contre il n'a pas de compacité en mangeant un Koopa vert , il peut évoluer ( en Yoshi bleu ) en trouvant des ailes dans un niveau.

La couleur Bleu : une espèce munie d ailes ou dans l'eau il peut manger n'importe quel Koopa il a toujours la compacité de voler, il a une deuxième capacité suivant la couleur des Koopa (cracher des boules de feu ou créer des mini séismes)

La couleur jaune : une espèce qui crée des mini séismes en mangeant n'importe quel Koopa, il a une deuxième capacité suivant la couleur des Koopa (cracher des boule de feu ou voler)

La couleur Rouge : une espèce qui crache des boules de feu en mangeant n'importe quel Koopa, il a une deuxième capacité suivant la couleur des Koopa (créer des mini séismes ou voler)